Antes de ir para cidade Cyllage o grupo decide parar pelo Instituto Sycamore. A Equipe Rocket decide raptar o professor Sycamore, assim como Serena e Bonnie, para erguer a mente do professor para os segredos por trás da mega Evolução enquanto Ash e Clemont tem que lidar com um pouco guloso Chespin com um gosto para doces. É revelado que a identidade do Mega Blaziken é na verdade o pai de Clemont e Bonnie Meyer.