O teste da nova geração de discos de duelo e do Deus do Obelisco, no mangá anteriores à batalha de dança, ocorrem agora no anime, com alterações: os discos lançam os projetores com foguetes e o robô de batalha não é andróide. Além disso, há no anime menções inexistentes a um sistema de satélites dando suporte aos duelos globalmente, e o duelo é estendido. Diferente do mangá, os cards da mão não são materializados na frente do jogador, e o computador usa Polimerização para fundir os três Dragões Brancos. A história do anime pula então para o capítulo 150 do mangá, onde Yugi descobre o início sobre quem é a partir da pedra em exibição. Ishizu Ishtar avisa-lhe que um inimigo possuidor de uma Relíquia do Milênio chagará à cidade, e que uma grande batalha ocorrerá; uma batalha para Yugi recuperar suas memórias.